ביוכימיה/אפיון השייר הצדדי של החומצות האמיניות השונות

חומצות אמינו הידרופוביות

עריכה

חומצה אמינית הידרופובית, כמו כל מולקולה הידרופובית לא מסיסה במים, כלומר, אינה יוצרת קשר כימי עם המים). הקשר הכימי הקיים הוא קשר ו.ד.ו, הנוצר בין מולקולות פוביות שונות.
כאשר בחלבון, יש חומצה הידרופובית בשייר R, הוא ממוקם בחלק פנימי של החלבון; באיזור בו אין מגע עם מים.
בחלבונים הממוקמים בממברנה יש הרבה חומצות אמיניות פוביות כיוון שהממברנה הינה פובית.

בעלות NH2 ו-COOH

חומצות אמינו נטרליות / קוטביות הידרופיליות

עריכה

חומצות הידרופוליות מסיסות במים, אשר אינן מתיינות ב-pH פזיולוגי, יוצרות קשר מימן עם המים. במילים אחרות, "קוטביות נטרליות". בעלות שתי תכונות :

  1. נטרליות.
  2. בעלות קשר מימן.
  3. בעלות O ובעלות H

חומצות אמינו טעונות חיובית

עריכה

מטען חומצות האמינו ב-pH :

  • ב-pH נמוך השייר טעון חיובית.
  • ב-pH גבוהה יש מעט יוני   בתמיסה ולכן, החומצה האמינית נטרלית.

החומצות האמיניות יוצרות קשר אלקרוסטטי ומימן.

חומצות אמינו טעונות שלילית

עריכה

חומצות אמינו הנושאות קבוצת   שיכולה לקבל מימן ולאבד את המטען ( ). ב-pH הפיזיולוגי הן טעונות שלילית.

סיכום

עריכה
חומצות אמינו הידרופיליות חומצות אמינו הידרופוביות חומצות אמינו טעונות חיובית (ל-א-ה) חומצות אמינו טעונות שלילית
גלוטמין (Gln) פנילאלנין (Phe) ליזין(Lys) חומצה אספרטית (Asp)
ציסטאין (Cys) טריפטופן (Trp) היסטדין (His) חומצה גלוטמית (Glu)
סרין (Ser) ולין (Val) ארגנין (Arg)
אספרגין ( Asn) מתיונין (Met)
תריאונין (Thr) פרולין (Pro)
גליצין (Gly) לאוצין (Leu)
טרוזין (Tyr) אלנין (Ala)
איזולאוצין (Ile)
  • חומצות אמינו בעלות טבעת בנזן - טריפטופן (Trp), פנילאלנין (Phe), אלנין.
  • חומצות אמינו בעלות שייר אליפסי (שרשרת פחמנית) - אלנין (Ala), לאוצין (Leu), פרולין (Pro), מתיונין (Met), איזולאוצין (Ile), | ולין (Val)
  • חומצות אמינו מכילות גופרית (S) - ציסטאין, מתיונין.
  • חומצות אמינו ארומטיות – לפירוט על התכונה לחץ כאן. החומצות : טירוזין, טריפטופן, פנילאלנין